Το συγκρότημα των εγκαταστάσεων του CRETAquarium βρίσκεται στην περιοχή της πρώην Αμερικανικής Βάσης στις Γούρνες, 14 χλμ από την πόλη του Ηρακλείου και το Διεθνές Αεροδρόμιο Νίκος Καζαντζάκης. Συνδέεται μέσω εθνικής οδού με τους σημαντικότερους προορισμούς της περιοχής.
Το κτιριακό συγκρότημα του CRETAquarium βρίσκεται στο χώρο της πρώην Αμερικανικής Βάσης στις Γούρνες, σε απόσταση 14 χλμ. από την πόλη του Ηρακλείου και το Διεθνές Αεροδρόμιο «Ν. Καζαντζάκης». Συνδέεται μέσω εθνικής οδού με τους σημαντικότερους προορισμούς της περιοχής. Συνδέεται μέσω εθνικής οδού με τους σημαντικότερους προορισμούς της περιοχής.
Οι ειδικές καφέ πληροφοριακές πινακίδες που βρίσκονται κατά μήκος του οδικού δικτύου της Κρήτης υποδεικνύουν το δρόμο προς το Ενυδρείο Κρήτης CRETAquarium. Στο χώρο του Ενυδρείου υπάρχει άνετος χώρος στάθμευσης.
Υπάρχει δυνατότητα ενοικίασης ιδιωτικών υπηρεσιών ΤΑΞΙ από και προς το CRETAquarium. Υπάρχουν αρκετές εταιρείες που δραστηριοποιούνται στην περιοχή
Σε κοντινή απόσταση από το CRETAquarium, βρίσκεται στάση των ΚΤΕΛ η οποία εξυπηρετεί δρομολόγια από Ηράκλειο καθώς και από την ευρύτερη περιοχή των Μαλίων-Χερσονήσου.